Lorentz Center - Karyotyping: from microscope to array from 17 Dec 2007 through 19 Dec 2007
  Current Workshop  |   Overview   Back  |   Home   |   Search   |     

    Karyotyping: from microscope to array
    from 17 Dec 2007 through 19 Dec 2007

 
WORKSHOP KARYOTYPING: FROM MICROSCOPE TO ARRAY

 

Monday, December 17

 

201      9:00 – 10:00    Arrival and coffee

 

201      10:00 – 11: 00 Introduction + overview of activities in participating laboratories

 

Each center presents in 5 min. its situation, previous work on arrays, plans for the near future

 

201      11:00 – 11:15  Peter Taschner: Introduction to human variation databases

 

201      11:15 – 12.45  Practicum finding ‘normal’ variations (Peter Taschner)

 

12.45 – 14.00  Lunch

 

201      14.00 – 14.30  Helen Firth: DECIPHER

 

‘3de’     14.30 – 16.30  Practicum DECIPHER (Helen Firth, Shola Richards)

(tea break ΰimproviste)

 

201      16.30 – 17.00  Nigel Carter: Disease and copy number variants

 

17.00 – 18.00  Wine and cheese party

 

Evening: diner in town  - choose a restaurant ΰimproviste

 

 

Tuesday, December 18

 

201      9:00 – 9:30      Conny van Ravenswaay ECARUCA

 

‘3de’     9:30 – 11.00    Practicum ECARUCA (Conny van Ravenswaay)

 

11:00 – 11:15  Coffee break

 

‘3de’     11:15 – 12.30  Joint session DECIPHER & ECARUCA, application of text mining programs (“Endeavor”, “Globe 3D Genome Viewer”, “Annie”)

 

12.30 – 13.30  Lunch

 

201      13.30 – 15.00  Introduction to oligonucleotide array platforms: Affymetrix, Illumina, Agilent,

 

‘3de’     15.00 – 17.30 Choose one of the following Practica:

                        Affymetrix (Joris Veltman)

                        Illumina (Claudia Ruivenkamp )

                        Agilent (Klaas Kok)

                       

                        What to include in an array report?

 

19:00   Dinner in town

 

 

Wednesday, December 19

 

‘3de’     9:00 – 12:30    Choose one of the following Practica:

                        Affymetrix (Joris Veltman)

                        Illumina (Claudia Ruivenkamp )

                        Agilent (Klaas Kok)

                       

                        What to include in an array report?

 

(11:00 – 11:15 Coffee break)

 

12.30 – 13.30 Lunch

 

201      13.30 – 14.15 The approach to the patient with congenital malformations and mental retardation

 

201      14.15 – 15.00 Do we still need microscopic karyotyping ? If so, for what indications ?

 

201      15.00 – 16.00 Summary and discussion of future plans

 

16.00 Closure, tea, departure

 

 

 

201:     Dit is een zaal voor 70 personen met projectiemogelijkheden.

 

‘3de’:    Hiermee worden de computerruimtes van het Lorentz Center bedoeld, op de 3de verdieping van het Oort gebouw.          In totaal zijn hier voor ons beschikbaar:

-          6 kamers voor 6 (tot max. 8) personen;

-          6 kamers voor 3 personen;

-          de Gratama ruimte met projectiemogelijkheden voor 33 personen.

In iedere ruimte staat 1 computer met internetverbinding en kunnen meegenomen laptops middels kabel of draadloos gebruik maken van het internet.



   [Back]